Table 2 Comparison of the results obtained with LRE based log2 ratios to the ΔCq analysis.
LRE based analysis | ΔCq based analysis | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
Mismatch Primer Pair | Log2 Ratio | SD | PValue1 | ΔCq | SD | PValue1 |
Clone GQ00612 _A24 (G-T) | ||||||
T1-PM | -5,4 | 0,6 | 3,4E-141 | 5,9 | 1,0 | 4,9E-109 |
T2-PM | -2,3 | 0,7 | 1,3E-66 | 2,9 | 1,0 | 1,3E-54 |
T3-PM | 0,3 | 0,5 | 1,4E-02 | 0,0 | 0,9 | 2,7E+01 |
PM-C1 | -0,2 | 0,4 | 2,1E-03 | 0,1 | 0,3 | 1,4E+01 |
PM-C2 | -7,3 | 0,6 | 7,1E-195 | 6,9 | 0,4 | 1,4E-155 |
T1-C1 | -5,8 | 0,6 | 7,8E-113 | 6,0 | 0,7 | 4,0E-84 |
T1-C2 | -13,1 | 0,9 | 2,4E-156 | 13,2 | 0,7 | 7,1E-130 |
T2-C1 | -2,7 | 0,6 | 2,0E-59 | 3,0 | 0,5 | 1,3E-43 |
T2-C2 | -9,4 | 0,6 | 2,1E-136 | 9,6 | 0,9 | 4,9E-108 |
T3-C1 | -0,1 | 0,5 | 5,5E-01 | 0,2 | 0,4 | 1,0E+01 |
T3-C2 | -7,1 | 0,5 | 2,3E-99 | 7,0 | 0,6 | 1,4E-79 |
Clone GQ0068 _E07 (G-G) | ||||||
T1-PM | -5,6 | 0,8 | 6,7E-154 | 6,0 | 0,7 | 1,0E-164 |
T2-PM | -2,3 | 0,4 | 3,9E-97 | 2,8 | 0,4 | 4,2E-123 |
T3-PM | 0,2 | 0,3 | 2,2E-04 | 0,0 | 0,4 | 2,9E+01 |
PM-A1 | 0,0 | 0,3 | 1,8E-02 | 0,2 | 0,3 | 2,3E-03 |
PM-A2 | -5,8 | 0,8 | 2,3E-173 | 6,7 | 0,6 | 1,1E-211 |
T1-A1 | -5,5 | 0,6 | 1,6E-126 | 6,2 | 0,7 | 3,9E-141 |
T1-A2 | -11,1 | 0,8 | 1,2E-171 | 12,5 | 0,7 | 8,3E-186 |
T2-A1 | -2,1 | 0,5 | 1,4E-59 | 2,8 | 0,6 | 3,6E-85 |
T2-A2 | -7,8 | 0,6 | 1,7E-157 | 9,4 | 0,5 | 9,3E-178 |
T3-A1 | 0,4 | 0,4 | 2,0E-04 | 0,0 | 0,3 | 3,2E+01 |
T3-A2 | -5,3 | 0,9 | 1,1E-120 | 6,6 | 0,7 | 1,2E-144 |
Clone GQ0065_F11 (T-G) | ||||||
G1-PM | -3,5 | 0,7 | 1,8E-109 | 3,5 | 0,7 | 3,9E-113 |
G2-PM | -0,6 | 0,5 | 6,3E-15 | 0,4 | 0,5 | 2,1E-08 |
G3-PM | 0,1 | 0,4 | 8,6E-04 | -0,2 | 0,3 | 5,7E+00 |
PM-A1 | 0,1 | 0,4 | 6,4E-04 | 0,0 | 0,4 | 2,9E+01 |
PM-A2 | -5,4 | 0,7 | 1,6E-164 | 6,2 | 0,6 | 1,5E-191 |
G1-A1 | -3,3 | 0,5 | 4,4E-75 | 3,5 | 0,5 | 1,5E-94 |
G1-A2 | -8,7 | 0,7 | 2,7E-152 | 9,5 | 0,9 | 1,2E-157 |
G2-A1 | -0,6 | 0,5 | 1,7E-09 | 0,6 | 0,5 | 2,5E-09 |
G2-A2 | -6,3 | 0,7 | 2,3E-129 | 6,7 | 0,4 | 4,6E-147 |
G3-A1 | 0,0 | 0,3 | 6,1E-01 | 0,1 | 0,3 | 1,7E+01 |
G3-A2 | -5,5 | 0,6 | 1,6E-117 | 6,0 | 0,5 | 1,3E-138 |