TY - JOUR AU - Ragauskas, A. J. AU - Williams, C. K. AU - Davison, B. H. AU - Britovsek, G. AU - Cairney, J. AU - Eckert, C. A. AU - Frederick, W. J. AU - Hallett, J. P. AU - Leak, D. J. AU - Liotta, C. L. AU - Mielenz, J. R. AU - Murphy, R. AU - Templer, R. AU - Tschaplinski, T. PY - 2006 DA - 2006// TI - The path forward for biofuels and biomaterials JO - Science VL - 311 UR - https://doi.org/10.1126/science.1114736 DO - 10.1126/science.1114736 ID - Ragauskas2006 ER - TY - JOUR AU - Collins, T. AU - Gerday, C. AU - Feller, G. PY - 2005 DA - 2005// TI - Xylanases, xylanase families and extremophilic xylanases JO - FEMS Microbiol Rev VL - 29 UR - https://doi.org/10.1016/j.femsre.2004.06.005 DO - 10.1016/j.femsre.2004.06.005 ID - Collins2005 ER - TY - JOUR AU - Kulkarni, N. AU - Shendye, A. AU - Rao, M. PY - 1999 DA - 1999// TI - Molecular and biotechnological aspects of xylanases JO - FEMS Microbiol Rev VL - 23 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.1999.tb00407.x DO - 10.1111/j.1574-6976.1999.tb00407.x ID - Kulkarni1999 ER - TY - JOUR AU - Haltrich, D. AU - Nidetzky, B. AU - Kulbe, K. D. AU - Steiner, W. AU - Zupancic, S. PY - 1996 DA - 1996// TI - Production of fungal xylanases JO - Bioresour Technol VL - 58 UR - https://doi.org/10.1016/S0960-8524(96)00094-6 DO - 10.1016/S0960-8524(96)00094-6 ID - Haltrich1996 ER - TY - JOUR AU - Li, K. AU - Azadi, P. AU - Collins, R. AU - Tolan, J. AU - Kim, J. S. AU - Eriksson, K. E. L. PY - 2000 DA - 2000// TI - Relationships between activities of xylanases and xylan structures JO - Enzyme Microb Technol VL - 27 UR - https://doi.org/10.1016/S0141-0229(00)00190-3 DO - 10.1016/S0141-0229(00)00190-3 ID - Li2000 ER - TY - JOUR AU - Biely, P. PY - 1985 DA - 1985// TI - Microbial xylanolytic systems JO - Trends Biotechnol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1016/0167-7799(85)90004-6 DO - 10.1016/0167-7799(85)90004-6 ID - Biely1985 ER - TY - JOUR AU - Subramaniyan, S. AU - Prema, P. PY - 2002 DA - 2002// TI - Biotechnology of microbial xylanases: enzymology, molecular biology, and application JO - Crit Rev Biotechnol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1080/07388550290789450 DO - 10.1080/07388550290789450 ID - Subramaniyan2002 ER - TY - JOUR AU - Puls, J. AU - Schmidt, O. AU - Granzow, C. PY - 1986 DA - 1986// TI - Glucuronidase in two microbial xylanolytic systems JO - Enzyme Microb Technol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/0141-0229(87)90147-5 DO - 10.1016/0141-0229(87)90147-5 ID - Puls1986 ER - TY - JOUR AU - Thomson, J. A. PY - 1993 DA - 1993// TI - Molecular biology of xylan degradation JO - FEMS Microbiol Rev VL - 104 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.1993.tb05864.x DO - 10.1111/j.1574-6968.1993.tb05864.x ID - Thomson1993 ER - TY - JOUR AU - Prade, R. A. PY - 1995 DA - 1995// TI - Xylanases: from biology to biotechnology JO - Biotechnol Genet Eng Rev VL - 13 ID - Prade1995 ER - TY - JOUR AU - Sunna, A. AU - Antranikian, G. PY - 1997 DA - 1997// TI - Xylanolytic enzymes from fungi and bacteria JO - Crit Rev Biotechnol VL - 17 UR - https://doi.org/10.3109/07388559709146606 DO - 10.3109/07388559709146606 ID - Sunna1997 ER - TY - JOUR AU - Polizeli, M. L. T. M. AU - Rizzatti, A. C. S. AU - Monti, R. AU - Terenzi, H. F. AU - Jorge, J. A. AU - Amorim, D. S. PY - 2005 DA - 2005// TI - Xylanases from fungi: properties and industrial applications JO - Appl Microbiol Biotechnol VL - 67 UR - https://doi.org/10.1007/s00253-005-1904-7 DO - 10.1007/s00253-005-1904-7 ID - Polizeli2005 ER - TY - JOUR AU - Chaudhary, K. AU - Tauro, P. PY - 1986 DA - 1986// TI - Synthesis of xylanase by Trichoderma reesei JO - MIRCEN J Appl Microbiol Biotechnol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1007/BF00933482 DO - 10.1007/BF00933482 ID - Chaudhary1986 ER - TY - JOUR AU - Fujita, Y. AU - Katahira, S. AU - Ueda, M. AU - Tanaka, A. AU - Okada, H. AU - Morikawa, Y. AU - Fukuda, H. AU - Kondo, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Construction of whole-cell biocatalyst for xylan degradation through cell-surface xylanase display in Saccharomyces cerevisiae JO - J Mol Catal B Enzym VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/S1381-1177(02)00027-9 DO - 10.1016/S1381-1177(02)00027-9 ID - Fujita2002 ER - TY - JOUR AU - Gawande, P. V. AU - Kamat, M. Y. PY - 1999 DA - 1999// TI - Production of Aspergillus xylanase by lignocellulosic waste fermentation and its application JO - J Appl Microbiol VL - 87 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2672.1999.00843.x DO - 10.1046/j.1365-2672.1999.00843.x ID - Gawande1999 ER - TY - JOUR AU - He, J. AU - Yu, B. AU - Zhang, K. AU - Ding, X. AU - Chen, D. PY - 2009 DA - 2009// TI - Expression of endo-1, 4-beta-xylanase from Trichoderma reesei in Pichia pastoris and functional characterization of the produced enzyme JO - BMC Biotechnol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1472-6750-9-56 DO - 10.1186/1472-6750-9-56 ID - He2009 ER - TY - JOUR AU - Smith, D. C. AU - Bhat, K. M. AU - Wood, T. M. PY - 1991 DA - 1991// TI - Xylan-hydrolysing enzymes from thermophilic and mesophilic fungi JO - World J Microbiol Biotechnol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1007/BF00303373 DO - 10.1007/BF00303373 ID - Smith1991 ER - TY - JOUR AU - Törrönen, A. AU - Mach, R. L. AU - Messner, R. AU - Gonzalez, R. AU - Kalkkinen, N. AU - Harkki, A. AU - Kubicek, C. P. PY - 1992 DA - 1992// TI - The two major xylanases from Trichoderma reesei: characterization of both enzymes and genes JO - Nat Biotechnol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1038/nbt1192-1461 DO - 10.1038/nbt1192-1461 ID - Törrönen1992 ER - TY - JOUR AU - Uchida, H. AU - Kusakabe, I. AU - Kawabata, Y. AU - Ono, T. AU - Murakami, K. PY - 1992 DA - 1992// TI - Production of xylose from xylan with intracellular enzyme system of Aspergillus niger 5–16 JO - J Ferment Bioeng VL - 74 UR - https://doi.org/10.1016/0922-338X(92)90075-6 DO - 10.1016/0922-338X(92)90075-6 ID - Uchida1992 ER - TY - JOUR AU - Dalbøge, H. PY - 1997 DA - 1997// TI - Expression cloning of fungal enzyme genes; a novel approach for efficient isolation of enzyme genes of industrial relevance JO - FEMS Microbiol Rev VL - 21 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.1997.tb00343.x DO - 10.1111/j.1574-6976.1997.tb00343.x ID - Dalbøge1997 ER - TY - JOUR AU - Grange, D. C. AU - Pretorius, I. S. AU - van-Zyl, W. H. PY - 1996 DA - 1996// TI - Expression of a Trichoderma reesei beta-xylanase gene (XYN2) in Saccharomyces cerevisiae JO - Appl Environ Microbiol VL - 62 ID - Grange1996 ER - TY - JOUR AU - Horikoshi, K. PY - 1996 DA - 1996// TI - Alkaliphiles - from an industrial point of view JO - FEMS Microbiol Rev VL - 18 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.1996.tb00242.x DO - 10.1111/j.1574-6976.1996.tb00242.x ID - Horikoshi1996 ER - TY - JOUR AU - Burchhardt, G. AU - Ingram, L. O. PY - 1992 DA - 1992// TI - Conversion of xylan to ethanol by ethanologenic strains of Escherichia coli and Klebsiella oxytoca JO - Appl Environ Microbiol VL - 58 ID - Burchhardt1992 ER - TY - JOUR AU - Wong, K. K. Y. AU - Tan, L. U. L. AU - Saddler, J. N. PY - 1988 DA - 1988// TI - Multiplicity of 3–1,4-xylanase in microorganisms: functions and applications JO - Microb Rev VL - 52 ID - Wong1988 ER - TY - JOUR AU - Spoeckner, S. AU - Wray, V. AU - Nimtz, M. AU - Lang, S. PY - 1999 DA - 1999// TI - Glycolipids of the smut fungus Ustilago maydis from cultivation on renewable resources JO - Appl Microbiol Biotechnol VL - 51 UR - https://doi.org/10.1007/s002530051359 DO - 10.1007/s002530051359 ID - Spoeckner1999 ER - TY - JOUR AU - Liu, J. AU - Koh, C. M. J. AU - Ji, L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Bioconversion of crude glycerol to glycolipids in Ustilago maydis JO - Bioresour Technol VL - 102 UR - https://doi.org/10.1016/j.biortech.2010.11.115 DO - 10.1016/j.biortech.2010.11.115 ID - Liu2011 ER - TY - CHAP AU - Feldbrügge, M. AU - Kellner, R. AU - Schipper, K. PY - 2013 DA - 2013// TI - The biotechnological use and potential of plant pathogenic smut fungi BT - Appl Microbiol Biotechnol ID - Feldbrügge2013 ER - TY - JOUR AU - Klement, T. AU - Milker, S. AU - Jäger, G. AU - Grande, P. M. AU - Büchs, J. AU - Domínguez de María, P. PY - 2012 DA - 2012// TI - Biomass pretreatment affects Ustilago maydis in producing itaconic acid JO - Microb Cell Fact VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2859-11-43 DO - 10.1186/1475-2859-11-43 ID - Klement2012 ER - TY - JOUR AU - Guevarra, E. D. AU - Tabuchi, T. PY - 1990 DA - 1990// TI - Accumulation of itaconic, 2-hydroxyparaconic, itatartaric, and malic acids by strains of the genus Ustilago JO - Agric Biol Chem VL - 54 UR - https://doi.org/10.1271/bbb1961.54.2353 DO - 10.1271/bbb1961.54.2353 ID - Guevarra1990 ER - TY - JOUR AU - Kämper, J. AU - Kahmann, R. AU - Bölker, M. AU - Ma, L. J. AU - Brefort, T. AU - Saville, B. J. AU - Banuett, F. AU - Kronstad, J. W. AU - Gold, S. E. AU - Müller, O. AU - Perlin, M. H. AU - Wösten, H. A. AU - de-Vries, R. AU - Ruiz-Herrera, J. AU - Reynaga-Peña, C. G. AU - Snetselaar, K. AU - McCann, M. AU - Pérez-Martín, J. AU - Feldbrügge, M. AU - Basse, C. W. AU - Steinberg, G. AU - Ibeas, J. I. AU - Holloman, W. AU - Guzman, P. AU - Farman, M. AU - Stajich, J. E. AU - Sentandreu, R. AU - González-Prieto, J. M. AU - Kennell, J. C. AU - Molina, L. PY - 2006 DA - 2006// TI - Insights from the genome of the biotrophic fungal plant pathogen Ustilago maydis JO - Nature VL - 444 UR - https://doi.org/10.1038/nature05248 DO - 10.1038/nature05248 ID - Kämper2006 ER - TY - JOUR AU - Schirawski, J. AU - Mannhaupt, G. AU - Münch, K. AU - Brefort, T. AU - Schipper, K. AU - Doehlemann, G. AU - Di-Stasio, M. AU - Rössel, N. AU - Mendoza-Mendoza, A. AU - Pester, D. AU - Müller, O. AU - Winterberg, B. AU - Meyer, E. AU - Ghareeb, H. AU - Wollenberg, T. AU - Münsterkötter, M. AU - Wong, P. AU - Walter, M. AU - Stukenbrock, E. AU - Güldener, U. AU - Kahmann, R. PY - 2010 DA - 2010// TI - Pathogenicity determinants in smut fungi revealed by genome comparison JO - Science VL - 10 UR - https://doi.org/10.1126/science.1195330 DO - 10.1126/science.1195330 ID - Schirawski2010 ER - TY - JOUR AU - Couturier, M. AU - Navarro, D. AU - Olivé, C. AU - Chevret, D. AU - Haon, M. AU - Favel, A. AU - Lesage-Meessen, L. AU - Henrissat, B. AU - Coutinho, P. M. AU - Berrin, J. G. PY - 2012 DA - 2012// TI - Post-genomic analyses of fungal lignocellulosic biomass degradation reveal the unexpected potential of the plant pathogen Ustilago maydis JO - BMC Genomics VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-13-57 DO - 10.1186/1471-2164-13-57 ID - Couturier2012 ER - TY - JOUR AU - Mueller, O. AU - Kahmann, R. AU - Aguilar, G. AU - Trejo-Aguilar, B. AU - Wub, A. AU - de-Vries, R. P. PY - 2008 DA - 2008// TI - The secretome of the maize pathogen Ustilago maydis JO - Fungal Genet Biol VL - 45 UR - https://doi.org/10.1016/j.fgb.2008.03.012 DO - 10.1016/j.fgb.2008.03.012 ID - Mueller2008 ER - TY - JOUR AU - Mendgen, K. AU - Hahn, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Plant infection and the establishment of fungal biotrophy JO - Trends Plant Sci VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/S1360-1385(02)02297-5 DO - 10.1016/S1360-1385(02)02297-5 ID - Mendgen2002 ER - TY - JOUR AU - Cano-Canchola, C. AU - Acevedo, L. AU - Ponce-Noyola, P. AU - Flores-Martínez, I. AU - Flores-Carreón, A. AU - Leal-Morales, C. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Induction of lytic enzymes by the interaction of Ustilago maydis with Zea mays tissues JO - Fungal Genet Biol VL - 29 UR - https://doi.org/10.1006/fgbi.2000.1196 DO - 10.1006/fgbi.2000.1196 ID - Cano-Canchola2000 ER - TY - JOUR AU - Willis, R. B. AU - Montgomery, M. E. AU - Allen, P. R. PY - 1996 DA - 1996// TI - Improved method for manual, colorimetric determination of total Kjeldahl nitrogen using salicylate JO - J Agric Food Chem VL - 44 UR - https://doi.org/10.1021/jf950522b DO - 10.1021/jf950522b ID - Willis1996 ER - TY - JOUR AU - Somogyi, M. PY - 1952 DA - 1952// TI - Notes on sugar determination JO - J Biol Chem VL - 195 ID - Somogyi1952 ER - TY - BOOK AU - Sambrook, J. AU - Russell, D. W. PY - 2001 DA - 2001// TI - Molecular cloning: a laboratory manual PB - Cold Spring Harbor Laboratory Press CY - New York ID - Sambrook2001 ER - TY - JOUR AU - Brachmann, A. AU - König, J. AU - Julius, C. AU - Feldbrügge, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - A reverse genetic approach for generating gene replacement mutants in Ustilago maydis JO - Mol Genet Genomics VL - 272 UR - https://doi.org/10.1007/s00438-004-1067-8 DO - 10.1007/s00438-004-1067-8 ID - Brachmann2004 ER - TY - JOUR AU - Matthies, C. AU - Erhard, H. P. AU - Drake, H. L. PY - 1997 DA - 1997// TI - Effects of pH on the comparative culturability of fungi and bacteria from acidic and less acidic forest soils JO - J Basic Microbiol VL - 37 UR - https://doi.org/10.1002/jobm.3620370506 DO - 10.1002/jobm.3620370506 ID - Matthies1997 ER - TY - JOUR AU - Miyazaki, K. AU - Martin, J. C. AU - Marinsek-Logar, R. AU - Flint, H. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Degradation and utilization of xylans by the rumen anaerobe Prevotella bryantii (formerly P. ruminicola subsp. brevis) B(1)4 JO - Anaerobe VL - 3 UR - https://doi.org/10.1006/anae.1997.0125 DO - 10.1006/anae.1997.0125 ID - Miyazaki1997 ER - TY - JOUR AU - Teplitsky, A. AU - Shulami, S. AU - Moryles, S. AU - Shoham, Y. AU - Shohama, G. PY - 2000 DA - 2000// TI - Crystallization and preliminary X-ray analysis of an intracellular xylanase from Bacillus stearothermophilus T-6 JO - Acta Crystallogr D: Biol Crystallogr VL - 56 UR - https://doi.org/10.1107/S0907444999013517 DO - 10.1107/S0907444999013517 ID - Teplitsky2000 ER - TY - JOUR AU - Fontes, C. M. AU - Gilbert, H. J. AU - Hazlewood, G. P. AU - Clarke, J. H. AU - Prates, J. A. AU - McKie, V. A. AU - Nagy, T. AU - Fernandes, T. H. AU - Ferreira, L. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - A novel Cellvibrio mixtus family 10 xylanase that is both intracellular and expressed under non-inducing conditions JO - Microbiology VL - 146 UR - https://doi.org/10.1099/00221287-146-8-1959 DO - 10.1099/00221287-146-8-1959 ID - Fontes2000 ER - TY - BOOK AU - Sjostrom, E. PY - 1993 DA - 1993// TI - Wood Chemistry. Fundamentals and Applications PB - Academic press CY - San Diego ID - Sjostrom1993 ER - TY - JOUR AU - Petersen, T. N. AU - Brunak, S. AU - von-Heijne, G. AU - Nielsen, H. PY - 2011 DA - 2011// TI - SignalP 4.0: discriminating signal peptides from transmembrane regions JO - Nat Methods VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth.1701 DO - 10.1038/nmeth.1701 ID - Petersen2011 ER - TY - JOUR AU - English, P. D. AU - Byrne, J. B. AU - Albersheim, P. PY - 1971 DA - 1971// TI - Host-pathogen interactions JO - Plant Physiol VL - 47 UR - https://doi.org/10.1104/pp.47.1.1 DO - 10.1104/pp.47.1.1 ID - English1971 ER - TY - JOUR AU - Cantarel, B. L. AU - Coutinho, P. M. AU - Rancurel, C. AU - Bernard, T. AU - Lombard, V. AU - Henrissat, B. PY - 2009 DA - 2009// TI - The Carbohydrate-Active EnZymes database (CAZy): an expert resource for glycogenomics JO - Nucleic Acids Res VL - 37 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkn663 DO - 10.1093/nar/gkn663 ID - Cantarel2009 ER - TY - JOUR AU - Mewes, H. W. AU - Amid, C. AU - Arnold, R. AU - Frishman, D. AU - Güldener, U. AU - Mannhaupt, G. AU - Münsterkötter, M. AU - Pagel, P. AU - Strack, N. AU - Stumpflen, V. AU - Warfsmann, J. AU - Ruepp, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - MIPS: analysis and annotation of proteins from whole genomes JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh092 DO - 10.1093/nar/gkh092 ID - Mewes2004 ER - TY - JOUR AU - Eliasson, A. AU - Christensson, C. AU - Wahlbom, C. F. AU - Hahn-Hägerdal, B. PY - 2000 DA - 2000// TI - Anaerobic xylose fermentation by recombinant Saccharomyces cerevisiae carrying XYL1, XYL2, and XKS1 in mineral medium chemostat cultures JO - Appl Environ Microbiol VL - 66 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.66.8.3381-3386.2000 DO - 10.1128/AEM.66.8.3381-3386.2000 ID - Eliasson2000 ER -